En 1992 en el Congreso Iberoamericano de Educación Ambiental realizado en la ciudad de Guadalajara, Jalisco, México, se planteó con relevancia la necesidad de que las Instituciones de Educación Superior de la región iberoamericana, ofrecieran posgrados de alto nivel académico en educación ambiental. Este evento fue organizado por la Universidad de Guadalajara (U. de G.), con el apoyo del Programa de las Naciones Unidas (PNUMA) y la Organización de las Naciones Unidas para la Educación, la Ciencia y la Cultura (UNESCO).

A partir de 1993, la Universidad de Guadalajara, asumió la tarea de conformar un proyecto de posgrado en Educación Ambiental, para lo cual realizó dos Reuniones Internacionales de Expertos en Educación Ambiental y campos afines a las que acudieron participantes de nueve países de las siguientes instituciones y universidades:

• Universidad de Guadalajara. México.
  
• Secretaría de Medio Ambiente, Recursos Naturales y Pesca, (CECADESU, D.F., México)
  
• Instituto Superior Pedagógico para la Educación Técnica y Profesional. Cuba.
  
• Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente. América Latina y el Caribe (PNUMA).
  
• Universidad Autónoma de Madrid. España
  
• La Universidad Federal de Mato Grosso. Brasil.
  
• Universidad Estatal a Distancia. Costa Rica.
  
• Universidad Pedagógica Nacional. Unidad Mexicali. México.
  
• Universidad de Mar de Plata. Argentina.
  
• Universidad Nacional de Colombia.
  
• Universidad Nacional Autónoma. Costa Rica.
  
• Universidad de Playa Ancha. Chile.
  
• Universidad Autónoma Metropolitana. Unidad Xochimilco. México.
  
• Universidad Pedagógica Experimental Libertador. Venezuela.

  Como resultado de estas reuniones se elaboró el proyecto curricular de la Maestría en Educación Ambiental, para así atender las demandas de profesionalización en Latinoamérica. El proyecto del programa de posgrado se sometió a Consejo General Universitario y se creó de manera oficial el 27 de septiembre de 1994. Desde su creación y hasta la fecha se han atendido a seis generaciones.
  La última modificación al plan de estudios fue aprobada el 12 de diciembre de 2006